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Bioinformatics application > Technology : Illumina HiSeq/NextSeq/MiSeq/Solexa or Ion proton or NGS or Pacific Biosciences

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Language:
C (1) · Java (2) · Perl (1) · Python (3) · R (1)
Operating system:
*NIX (1) · 10.8 (1) · Linux (1) · Linux 64 (1) · Linux CentOS 6.5 (1) · Linux Ubuntu 12.04 (1) · Mac OS X (1) · Mac OS X 10.7 (1) · UNIX (1) · Unix-like (1) · Windows (1) · Windows 7 64-bit or Higher (1) · or 10.9 (1) · tested for Linux (Ubuntu) (1)
Maintained:
Yes (6)
Licence:
Commercial (2) · GPLv3 (2)
Technology: (Click arrow to add another value)
Bioinformatics method:
Analysis (1) · Biological interpretation (1) · Mapping (1) · Peak calling (1) · Read mapping (2) · Sequence alignment (4) · Sequence alignment analysis (1) · Sequence analysis (1) · Sequence assembly (1) · Sequencing quality control (1) · Visualisation (1)
Biological domain:
CLIP-Seq (1) · ChIP-seq (2) · DNA-Seq (1) · Exome (1) · Exome analysis (1) · Exome and whole genome variant detection (1) · Exome capture (1) · Gene structure (1) · Genomics (3) · HITS-CLIP (1) · ICLIP (1) · Indel detection (1) · MeDIP-Seq (1) · Methyl-Seq (1) · PAR-CLIP (1) · Pathway or network analysis (1) · RNA (1) · RNA-Seq (2) · RNA-Seq alignment (1) · Regulatory genomics (1) · Resequencing (1) · SNP detection (1) · Sequence assembly (de-novo assembly) (1) · Sequence assembly (de novo assembly) (1) · Sequencing (2) · Small RNA-Seq (1) · Transcriptome assembly (1) · Whole genome resequencing (2)

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