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Bioinformatics application > Maintained : No or Other & Bioinformatics method : Genome indexing (Burrows-Wheeler) or Sequence assembly

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Operating system:
10 (1) · 10.8 (1) · 8 (1) · Cross-Platform (2) · Linux (33) · Linux 64 (7) · Linux CentOS 6.5 (1) · Linux Ubuntu 12.04 (1) · Mac OS X (14) · Mac OS X 10.7 (2) · POSIX (3) · Solaris (1) · UNIX (7) · Windows (12) · Windows 7 64-bit or Higher (1) · Windows 7 or Higher (2) · Windows XP (1) · any (1) · cloud (1) · interoperable (1) · or 10.9 (2)
Maintained: (Click arrow to add another value)
Licence:
AGPL (1) · Apache License 2.0 (1) · Artistic License (1) · BCCA (academic use) (1) · BSD (2) · C++ (1) · CeCILL (4) · CeCILL-C license (1) · Commercial (15) · Free for academic use; Commercial (1) · Freeware (4) · GPL (5) · GPLv2 (4) · GPLv3 (7) · Open Source (1) · Unknown (1)
Technology:
454 (27) · ABI SOLiD (10) · Any (2) · Any sequencing platform (1) · Anything that can be assembled with Celera or Newbler (1) · Helicos (2) · Illumina (36) · Ion Torrent (10) · PacBio (5) · Pacific Biosciences (1) · Roche 454 (1) · Sanger (23)
Bioinformatics method: (Click arrow to add another value)
Biological domain:
Alternative splicing (1) · ChIP-seq (5) · Clone verification (2) · Comparative genomics (5) · Data handling (1) · De-novo assembly (1) · Epidemiology (1) · Epigenomics (2) · Exome capture (3) · Functional genomics (1) · Gene structure (2) · Genetic variation analysis (1) · Genomics (19) · Genotyping (1) · Indel detection (7) · Mapping (4) · Metagenomics (5) · Microbial Surveillance (2) · Phylogenetics (2) · Population genetics (1) · Protein structure analysis (1) · Quality control (1) · RNA-Seq (5) · RNA-Seq alignment (5) · RNA-Seq quantification (2) · Regulatory RNA (2) · SNP detection (13) · Sequence analysis (4) · Sequence assembly (7) · Sequence assembly (de-novo assembly) (2) · Sequence assembly (de novo assembly) (27) · Sequencing (3) · Structural variation (4) · Transcription factors and regulatory sites (1) · Transcriptome assembly (2) · Transcriptomics (5) · Whole genome resequencing (4) · Workflows (1)

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